Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms