Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Elp3Q9CZX0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Elp3Q9CZX0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms