Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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