Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chd1lQ9CXF7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chd1lQ9CXF7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1lQ9CXF7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Chd1lQ9CXF7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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