Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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