Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddx28Q9CWT6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ddx28Q9CWT6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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