Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pfdn1Q9CWM4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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