Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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