Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms