Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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