Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dis3Q9CSH3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms