Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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