Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms