Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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