Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms