Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms