Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC7

Ndufb4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb4Q9CQC7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ndufb4Q9CQC7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ndufb4Q9CQC7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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