Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NenfQ9CQ45 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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