Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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