Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms