Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sf3b1Q99NB9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sf3b1Q99NB9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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