Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6dQ99N07 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms