Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tdrd1Q99MV1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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