Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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