Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trps1Q925H1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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