Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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