Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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