Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usb1Q91W78 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usb1Q91W78 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usb1Q91W78 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usb1Q91W78 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usb1Q91W78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usb1Q91W78 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usb1Q91W78 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usb1Q91W78 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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