Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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