Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Col26a1Q91VF6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col26a1Q91VF6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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