Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms