Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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