Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms