Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpap2Q8VC34 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpap2Q8VC34 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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