Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan8Q8R3G9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms