Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OptnQ8K3K8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms