Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr3Q8K296 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms