Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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