Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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