Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkn3Q8K045 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms