Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LgsnQ8CIX8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms