Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms