Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm9958Q8C9U4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms