Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rtp1Q8C8C1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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