Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp20Q8C6M1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp20Q8C6M1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp20Q8C6M1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp20Q8C6M1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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