Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms