Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms