Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms