Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pnma1Q8C1C8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pnma1Q8C1C8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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