Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx16Q8C080 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms